近期國發基金投資的生技公司三顧風波不斷，今年7月，現任副董事長陳宗基被人指控，疑似以不實申請書向經濟部工業局申請補助款，有律師表示，這恐涉嫌違反特別背信罪及詐欺未遂罪。
據鏡周刊報導，陳宗基曾以自己為計畫主持人，向經濟部提出「膝軟骨細胞治療技術銜接細胞治療製劑開發計畫」之補助申請，卻沒有經過義大醫院院長杜元坤同意，擅自在計畫書中使用杜院長的研發成果簡報內容，還將杜院長在義大醫院通過HTO（高脛骨截骨手術）、與該計畫完全無關之IRB（人體試驗審查）列為該計畫書之附件，逕送經濟部審查。
杜元坤發現後相當氣憤，還去函三顧，並要求查明相關情事，整件事才東窗事發。一名律師分析：「陳宗基事後雖已撤下該補助申請，其過往行為恐怕已違背其職務，並使三顧公司受有損害，恐涉嫌違反特別背信罪及詐欺未遂罪。」
而陳宗基在涉嫌疑似詐取經濟部補助案後，近期再爆做假。8月底陳宗基出庭應訊，說明遭超基因生技公司指控涉及背信罪後，在庭外受訪時，反指他最近被潑髒水攻擊，還點名特定媒體配合超基因，以一連串未查證的惡意報導進行抹黑，嚴重損害公司形象與股東利益。未料，原本試圖透過記者會創造聲量，卻被踢爆受訪現場做假。
根據媒體報導，陳宗基出庭應訊的前一天，曾透過某公關公司發出採訪通知，希望各家媒體前往報導，但多數記者沒有興趣，因此當天出席的人屈指可數，但在受訪現場竟出現TVBS、東森2家電視台的麥克風，而這兩家電視台當天根本沒有派人前往採訪，現場採訪的麥克風偽造得跟真的一樣。一名在線記者表示：「這樣的行徑實在太誇張，竟然有人利用知名媒體試圖製造輿論，相關行徑恐怕已經違法。」
事實上，陳宗基的爭議行徑一籮筐。過去中天新聞等多家媒體曾報導，他被日商Cellseed指控獨家技術遭偷賣中國大陸，今年7月，Cellseed在官網發出聲明，指控三顧欲將日方所擁有的自體軟體細胞層片等核心技術，以新台幣50億元技轉至中國，此舉已涉嫌違背合作協議，目前已委任律師採取法律行動。
三顧身為國發基金挹注的企業之一，不斷爆出爭議已經引發市場關注，在相關爭議至今尚未被釐清之際，近期子公司樂迦再生也被媒體爆出，公司在創立初期，有人想利用中研院前院長翁啟惠炒股的負面消息，知情人士指出，這恐怕只能用夜路走多了，總會遇到鬼來形容。
